'De tijdmachine' is het superspannende vervolg op het eerste deel van de avonturen van Thomas, Rutger en hun hond Paco. De katachtige Professnor blijft onze helden dwarszitten. In dit tweede deel stuurt hij de drie via een tijdmachine naar het verleden. Zo komen ze terecht in de tijd van de Egyptenaren, de dinosaurussen, de Vikingen en nog veel meer.

Hoe moeten Rutger, Thomas en Paco weer terugreizen naar het heden? En zal het lukken om de Professnor voor eens en voor altijd uit te schakelen?